人體組織基因活性大規模破譯
來源：科技日報 2017-10-12 16:25:40
我們能破譯所有人體組織的基因活性嗎?英國《自然》和《自然·遺傳學》雜志10日發表一系列基因組學論文，全面介紹了基因表達在人體不同組織和不同個體中的差異，這些發現為認識健康組織中基因變異和基因表達的關聯帶來了新啟示，為揭示有關疾病分子的起源提供了新線索。
人類基因組編碼指令調控著基因表達，基因表達因細胞類型的不同而存在差異，產生具有不同功能的多樣化組織;它們在不同個體中也存在差異。驅動這些差異產生的序列一般處于基因組的非編碼區域，它們決定基因表達的方式和時間。但是，目前有關基因調控和基因表達在不同人體組織和個體中的差異的研究仍然有限。
基因型—組織表達(GTEx)研究聯盟收集并研究了來自449名生前健康的人類捐獻者的7000多份尸檢樣本，涵蓋44個組織(42種不同的組織類型)，包括31個實體器官組織、10個腦分區、全血、兩個來自捐獻者血液和皮膚的細胞系，美國博德研究所科學家利用這些樣本，分析了基因表達在不同組織和個體中有何差異。他們采用了表達定量性狀遺傳位點(eQTL)作圖法，顯示大多數的人類基因受局部變異的影響，變異序列靠近受影響的基因。同時還鑒定出有93個基因的表達受到距離較遠的變異的影響，包括位于不同染色體上的變異。
《自然》另一篇論文考察了罕見變異在基因表達中的作用，兩篇論文采用GTEx數據，探討了與基因表達相關聯的基因變異如何能調節RNA編輯和X染色體失活現象。在《自然·遺傳學》的文章中，作者介紹了GTEx項目的擴展，其為研究遺傳差異如何通過分子表型一步步影響人類健康提供了資源。
綜合而言，這些成果凸顯了源自不同個體和不同組織的數據對于鑒定人類疾病相關變異背后的基因和機制的價值。芝加哥大學科學家在評論文章中稱：各方齊心協力，克服了大規模獲取人體死后樣本所存在的倫理、法律和技術挑戰，所生成的廣泛數據，使人類向破譯基因組調控密碼又前進了一步，而基因變異對于基因表達的影響正逐漸變得明晰起來。
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